经国务院2021年8月7日批准，2021年9月7日，国家林业和草原局、农业农村部2021年第15号公告公布施行了新的《国家重点保护野生植物名录》。该《名录》，共列入国家重点保护野生植物455种和40类，包括国家一级保护野生植物54种和4类，国家二级保护野生植物401种和36类。其中，由林业和草原主管部门分工管理的324种和25类，由农业农村主管部门分工管理的131种和15类。
四川天然原生的列入该《名录》的野生植物共有98种和30类，包括国家一级保护野生植物6种和3类（由林业和草原主管部门分工管理的4种和2类），国家二级保护野生植物92种和27类（由林业和草原主管部门分工管理的57种和17类）。其中，由林业和草原主管部门分工管理的61种和19类，由农业农村主管部门分工管理的37种和11类。
参考Flora of China、《中国植物志》及部分《四川植物志》等分类著述，除开苏铁Cycas revoluta、银杏Ginkgo biloba、翠柏Calocedrus macrolepis、西藏柏木Cupressus torulosa、水杉Metasequoia glyptostroboides、台湾杉（秃杉）Taiwania cryptomerioides、银杉Cathaya argyrophylla、天竺桂Cinnamomum japonicum、中华结缕草Zoysia sinica、降香Dalbergia odorifera、南川木波罗Artocarpus nanchuanensis、普陀鹅耳枥Carpinus putoensis、黄檗Phellodendron amurense、杜鹃红山茶Camellia azalea、野生荔枝Litchi chinensis var. euspontanea等在四川栽培的以及尚不确定四川有无天然分布的物种之外，四川天然原生的国家重点保护野生植物有231种（藻类0种、真菌3种、苔藓植物3种、石松类和蕨类植物21种、裸子植物18种、被子植物186种），见下表。其中，国家一级保护野生植物11种（林业和草原主管部门分工管理8种，农业农村主管部门分工管理3种），国家二级保护野生植物220种（林业和草原主管部门分工管理145种，农业农村主管部门分工管理75种）。
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中文名 |
拉丁学名 |
保护级别 |
分工 |
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光叶蕨 |
Cystopteris chinensis |
一级 |
林草 |
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攀枝花苏铁 |
Cycas panzhihuaensis |
一级 |
林草 |
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四川苏铁 |
Cycas szechuanensis |
一级 |
林草 |
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崖柏 |
Thuja sutchuenensis |
一级 |
林草 |
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红豆杉 |
Taxus wallichiana var. chinensis |
一级 |
林草 |
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南方红豆杉 |
Taxus wallichiana var. mairei |
一级 |
林草 |
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云南红豆杉 |
Taxus yunnanensis |
一级 |
林草 |
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峨眉拟单性木兰 |
Parakmeria omeiensis |
一级 |
林草 |
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珙桐 |
Davidia involucrata |
一级 |
林草 |
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桧叶白发藓 |
Leucobryum juniperoideum |
二级 |
林草 |
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中华石杉 |
Huperzia chinensis |
二级 |
林草 |
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峨眉石杉 |
Huperzia emeiensis |
二级 |
林草 |
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雷波石杉 |
Huperzia laipoensis |
二级 |
林草 |
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南川石杉 |
Huperzia nanchuanensis |
二级 |
林草 |
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小杉兰 |
Huperzia selago |
二级 |
林草 |
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皱边石杉 |
Huperzia crispata |
二级 |
林草 |
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华西石杉 |
Huperzia dixitiana |
二级 |
林草 |
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锡金石杉 |
Huperzia herteriana |
二级 |
林草 |
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康定石杉 |
Huperzia kangdingensis |
二级 |
林草 |
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凉山石杉 |
Huperzia liangshanica |
二级 |
林草 |
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蛇足石杉 |
Huperzia serrata |
二级 |
林草 |
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四川石杉 |
Huperzia sutchueniana |
二级 |
林草 |
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华南马尾杉 |
Phlegmariurus austrosinicus |
二级 |
林草 |
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闽浙马尾杉 |
Phlegmariurus mingcheensis |
二级 |
林草 |
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有柄马尾杉 |
Phlegmariurus petiolatus |
二级 |
林草 |
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福建观音座莲 |
Angiopteris fokiensis |
二级 |
林草 |
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金毛狗 |
Cibotium barometz |
二级 |
林草 |
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桫椤 |
Alsophila spinulosa |
二级 |
林草 |
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罗汉松 |
Podocarpus macrophyllus |
二级 |
林草 |
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百日青 |
Podocarpus neriifolius |
二级 |
林草 |
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岷江柏木 |
Cupressus chengiana |
二级 |
林草 |
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福建柏 |
Fokienia hodginsii |
二级 |
林草 |
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穗花杉 |
Amentotaxus argotaenia |
二级 |
林草 |
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篦子三尖杉 |
Cephalotaxus oliveri |
二级 |
林草 |
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巴山榧树 |
Torreya fargesii |
二级 |
林草 |
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四川榧 |
Torreya parvifolia |
二级 |
林草 |
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大果青扦 |
Picea neoveitchii |
二级 |
林草 |
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澜沧黄杉 |
Pseudotsuga forrestii |
二级 |
林草 |
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黄杉 |
Pseudotsuga sinensis |
二级 |
林草 |
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西昌黄杉 |
Pseudotsuga xichangensis |
二级 |
林草 |
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厚朴 |
Houpoëa officinalis |
二级 |
林草 |
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鹅掌楸（马褂木） |
Liriodendron chinense |
二级 |
林草 |
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峨眉含笑 |
Michelia wilsonii |
二级 |
林草 |
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圆叶天女花（圆叶玉兰） |
Oyama sinensis |
二级 |
林草 |
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西康天女花（西康玉兰） |
Oyama wilsonii |
二级 |
林草 |
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油樟 |
Cinnamomum longepaniculatum |
二级 |
林草 |
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润楠 |
Machilus nanmu |
二级 |
林草 |
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细叶楠 |
Phoebe hui |
二级 |
林草 |
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楠木 |
Phoebe zhennan |
二级 |
林草 |
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芒苞草 |
Acanthochlamys bracteata |
二级 |
林草 |
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大理铠兰 |
Corybas taliensis |
二级 |
林草 |
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杜鹃兰 |
Cremastra appendiculata |
二级 |
林草 |
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独花兰 |
Changnienia amoena |
二级 |
林草 |
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建兰 |
Cymbidium ensifolium |
二级 |
林草 |
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蕙兰 |
Cymbidium faberi |
二级 |
林草 |
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春兰 |
Cymbidium goeringii |
二级 |
林草 |
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虎头兰 |
Cymbidium hookerianum |
二级 |
林草 |
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黄蝉兰 |
Cymbidium iridioides |
二级 |
林草 |
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寒兰 |
Cymbidium kanran |
二级 |
林草 |
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大根兰 |
Cymbidium macrorhizon |
二级 |
林草 |
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墨兰 |
Cymbidium sinense |
二级 |
林草 |
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西藏虎头兰 |
Cymbidium tracyanum |
二级 |
林草 |
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川西兰 |
Cymbidium sichuanicum |
二级 |
林草 |
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冬凤兰 |
Cymbidium dayanum |
二级 |
林草 |
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豆瓣兰 |
Cymbidium serratum |
二级 |
林草 |
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多花兰 |
Cymbidium floribundum |
二级 |
林草 |
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莲瓣兰 |
Cymbidium tortisepalum |
二级 |
林草 |
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落叶兰 |
Cymbidium defoliatum |
二级 |
林草 |
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莎草兰 |
Cymbidium elegans |
二级 |
林草 |
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莎叶兰 |
Cymbidium cyperifolium |
二级 |
林草 |
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长叶兰 |
Cymbidium erythraeum |
二级 |
林草 |
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无苞杓兰 |
Cypripedium bardolphianum |
二级 |
林草 |
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对叶杓兰 |
Cypripedium debile |
二级 |
林草 |
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毛瓣杓兰 |
Cypripedium fargesii |
二级 |
林草 |
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华西杓兰 |
Cypripedium farreri |
二级 |
林草 |
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大叶杓兰 |
Cypripedium fasciolatum |
二级 |
林草 |
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黄花杓兰 |
Cypripedium flavum |
二级 |
林草 |
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毛杓兰 |
Cypripedium franchetii |
二级 |
林草 |
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紫点杓兰 |
Cypripedium guttatum |
二级 |
林草 |
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扇脉杓兰 |
Cypripedium japonicum |
二级 |
林草 |
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大花杓兰 |
Cypripedium macranthos |
二级 |
林草 |
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斑叶杓兰 |
Cypripedium margaritaceum |
二级 |
林草 |
|
小花杓兰 |
Cypripedium micranthum |
二级 |
林草 |
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巴郎山杓兰 |
Cypripedium palangshanense |
二级 |
林草 |
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山西杓兰 |
Cypripedium shanxiense |
二级 |
林草 |
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四川杓兰 |
Cypripedium sichuanense |
二级 |
林草 |
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褐花杓兰 |
Cypripedium calcicola |
二级 |
林草 |
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太白杓兰 |
Cypripedium taibaiense |
二级 |
林草 |
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西藏杓兰 |
Cypripedium tibeticum |
二级 |
林草 |
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云南杓兰 |
Cypripedium yunnanense |
二级 |
林草 |
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绿花杓兰 |
Cypripedium henryi |
二级 |
林草 |
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高山杓兰 |
Cypripedium himalaicum |
二级 |
林草 |
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宽口杓兰 |
Cypripedium wardii |
二级 |
林草 |
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丽江杓兰 |
Cypripedium lichiangense |
二级 |
林草 |
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杓兰 |
Cypripedium calceolus |
二级 |
林草 |
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华西蝴蝶兰 |
Phalaenopsis wilsonii |
二级 |
林草 |
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独蒜兰 |
Pleione bulbocodioides |
二级 |
林草 |
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云南独蒜兰 |
Pleione yunnanensis |
二级 |
林草 |
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黄花独蒜兰 |
Pleione forrestii |
二级 |
林草 |
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卡氏独蒜兰 |
Pleione kaatiae |
二级 |
林草 |
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四川独蒜兰 |
Pleione limprichtii |
二级 |
林草 |
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美丽独蒜兰 |
Pleione pleionoides |
二级 |
林草 |
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无芒披碱草 |
Elymus sinosubmuticus |
二级 |
林草 |
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箭叶大油芒 |
Spodiopogon sagittifolius |
二级 |
林草 |
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石生黄堇 |
Corydalis saxicola |
二级 |
林草 |
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红花绿绒蒿 |
Meconopsis punicea |
二级 |
林草 |
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小八角莲 |
Dysosma difformis |
二级 |
林草 |
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贵州八角莲 |
Dysosma majoensis |
二级 |
林草 |
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六角莲 |
Dysosma pleiantha |
二级 |
林草 |
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川八角莲 |
Dysosma delavayi |
二级 |
林草 |
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八角莲 |
Dysosma versipellis |
二级 |
林草 |
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桃儿七 |
Sinopodophyllum hexandrum |
二级 |
林草 |
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独叶草 |
Kingdonia uniflora |
二级 |
林草 |
|
水青树 |
Tetracentron sinense |
二级 |
林草 |
|
连香树 |
Cercidiphyllum japonicum |
二级 |
林草 |
|
大花红景天 |
Rhodiola crenulata |
二级 |
林草 |
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长鞭红景天 |
Rhodiola fastigiata |
二级 |
林草 |
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喜马红景天 |
Rhodiola himalensis |
二级 |
林草 |
|
唐古红景天 |
Rhodiola tangutica |
二级 |
林草 |
|
粗茎红景天 |
Rhodiola wallichiana |
二级 |
林草 |
|
云南红景天 |
Rhodiola yunnanensis |
二级 |
林草 |
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花榈木 |
Ormosia henryi |
二级 |
林草 |
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红豆树 |
Ormosia hosiei |
二级 |
林草 |
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雅安红豆 |
Ormosia yaanensis |
二级 |
林草 |
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雅砻江冬麻豆 |
Salweenia bouffordiana |
二级 |
林草 |
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单瓣月季花 |
Rosa chinensis var. spontanea |
二级 |
林草 |
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亮叶月季 |
Rosa lucidissima |
二级 |
林草 |
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大叶榉树 |
Zelkova schneideriana |
二级 |
林草 |
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台湾水青冈 |
Fagus hayatae |
二级 |
林草 |
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尖叶栎 |
Quercus oxyphylla |
二级 |
林草 |
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梓叶槭 |
Acer amplum subsp. catalpifolium |
二级 |
林草 |
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五小叶槭 |
Acer pentaphyllum |
二级 |
林草 |
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伞花木 |
Eurycorymbus cavaleriei |
二级 |
林草 |
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川黄檗 |
Phellodendron chinense |
二级 |
林草 |
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红椿 |
Toona ciliata |
二级 |
林草 |
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云南梧桐 |
Firmiana major |
二级 |
林草 |
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平当树 |
Paradombeya sinensis |
二级 |
林草 |
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伯乐树（钟萼木） |
Bretschneidera sinensis |
二级 |
林草 |
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疏花水柏枝 |
Myricaria laxiflora |
二级 |
林草 |
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金铁锁 |
Psammosilene tunicoides |
二级 |
林草 |
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棱果秤锤树 |
Sinojackia henryi |
二级 |
林草 |
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乐山秤锤树 |
Sinojackia xylocarpa var. leshanensis |
二级 |
林草 |
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肉果秤锤树 |
Sinojackia sarcocarpa |
二级 |
林草 |
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尾叶杜鹃 |
Rhododendron urophyllum |
二级 |
林草 |
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圆叶杜鹃 |
Rhododendron williamsianum |
二级 |
林草 |
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香果树 |
Emmenopterys henryi |
二级 |
林草 |
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胡黄连 |
Neopicrorhiza scrophulariiflora |
二级 |
林草 |
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崖白菜 |
Triaenophora rupestris |
二级 |
林草 |
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扣树 |
Ilex kaushue |
二级 |
林草 |
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巴朗山雪莲 |
Saussurea balangshanensis |
二级 |
林草 |
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绵头雪兔子 |
Saussurea laniceps |
二级 |
林草 |
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水母雪兔子 |
Saussurea medusa |
二级 |
林草 |
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匙叶甘松 |
Nardostachys jatamansi |
二级 |
林草 |
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虫草（冬虫夏草） |
Ophiocordyceps sinensis |
二级 |
林草 |
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高寒水韭 |
Isoetes hypsophila |
一级 |
农业 |
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曲茎石斛 |
Dendrobium flexicaule |
一级 |
农业 |
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紫斑牡丹 |
Paeonia rockii |
一级 |
农业 |
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多纹泥炭藓 |
Sphagnum multifibrosum |
二级 |
农业 |
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粗叶泥炭藓 |
Sphagnum squarrosum |
二级 |
农业 |
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水蕨 |
Ceratopteris thalictroides |
二级 |
农业 |
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莼菜 |
Brasenia schreberi |
二级 |
农业 |
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海菜花 |
Ottelia acuminata |
二级 |
农业 |
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龙舌草 |
Ottelia alismoides |
二级 |
农业 |
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冰沼草 |
Scheuchzeria palustris |
二级 |
农业 |
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球药隔重楼 |
Paris fargesii |
二级 |
农业 |
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七叶一枝花 |
Paris polyphylla |
二级 |
农业 |
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黑籽重楼 |
Paris thibetica |
二级 |
农业 |
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毛重楼 |
Paris mairei |
二级 |
农业 |
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花叶重楼 |
Paris marmorata |
二级 |
农业 |
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巴山重楼 |
Paris bashanensis |
二级 |
农业 |
|
川贝母 |
Fritillaria cirrhosa |
二级 |
农业 |
|
华西贝母 |
Fritillaria sichuanica |
二级 |
农业 |
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梭砂贝母 |
Fritillaria delavayi |
二级 |
农业 |
|
天目贝母 |
Fritillaria monantha |
二级 |
农业 |
|
粗茎贝母 |
Fritillaria crassicaulis |
二级 |
农业 |
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甘肃贝母 |
Fritillaria przewalskii |
二级 |
农业 |
|
太白贝母 |
Fritillaria taipaiensis |
二级 |
农业 |
|
暗紫贝母 |
Fritillaria unibracteata |
二级 |
农业 |
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米贝母 |
Fritillaria davidii |
二级 |
农业 |
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绿花百合 |
Lilium fargesii |
二级 |
农业 |
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乳头百合 |
Lilium papilliferum |
二级 |
农业 |
|
峨眉金线兰 |
Anoectochilus emeiensis |
二级 |
农业 |
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金线兰 |
Anoectochilus roxburghii |
二级 |
农业 |
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白及 |
Bletilla striata |
二级 |
农业 |
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叠鞘石斛 |
Dendrobium denneanum |
二级 |
农业 |
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细叶石斛 |
Dendrobium hancockii |
二级 |
农业 |
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细茎石斛 |
Dendrobium moniliforme |
二级 |
农业 |
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石斛 |
Dendrobium nobile |
二级 |
农业 |
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铁皮石斛 |
Dendrobium officinale |
二级 |
农业 |
|
串珠石斛 |
Dendrobium falconeri |
二级 |
农业 |
|
兜唇石斛 |
Dendrobium cucullatum |
二级 |
农业 |
|
夹江石斛 |
Dendrobium jiajiangense |
二级 |
农业 |
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矩唇石斛 |
Dendrobium linawianum |
二级 |
农业 |
|
线叶石斛 |
Dendrobium chryseum |
二级 |
农业 |
|
天麻 |
Gastrodia elata |
二级 |
农业 |
|
西南手参 |
Gymnadenia orchidis |
二级 |
农业 |
|
手参 |
Gymnadenia conopsea |
二级 |
农业 |
|
水仙花鸢尾 |
Iris narcissiflora |
二级 |
农业 |
|
细莪术 |
Curcuma exigua |
二级 |
农业 |
|
黑紫披碱草 |
Elymus atratus |
二级 |
农业 |
|
短柄披碱草 |
Elymus brevipes |
二级 |
农业 |
|
拟高梁 |
Sorghum propinquum |
二级 |
农业 |
|
黄连 |
Coptis chinensis |
二级 |
农业 |
|
三角叶黄连 |
Coptis deltoidea |
二级 |
农业 |
|
峨眉黄连 |
Coptis omeiensis |
二级 |
农业 |
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古蔺黄连 |
Coptis guilinensis |
二级 |
农业 |
|
线萼黄连 |
Coptis linearisepala |
二级 |
农业 |
|
莲 |
Nelumbo nucifera |
二级 |
农业 |
|
四川牡丹 |
Paeonia decomposita |
二级 |
农业 |
|
滇牡丹 |
Paeonia delavayi |
二级 |
农业 |
|
圆裂牡丹 |
Paeonia rotundiloba |
二级 |
农业 |
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乌苏里狐尾藻 |
Myriophyllum ussuriense |
二级 |
农业 |
|
山豆根 |
Euchresta japonica |
二级 |
农业 |
|
野大豆 |
Glycine soja |
二级 |
农业 |
|
甘肃桃 |
Prunus kansuensis |
二级 |
农业 |
|
光核桃 |
Prunus mira |
二级 |
农业 |
|
丽江山荆子 |
Malus rockii |
二级 |
农业 |
|
川桑 |
Morus notabilis |
二级 |
农业 |
|
细果野菱（野菱） |
Trapa incisa |
二级 |
农业 |
|
宜昌橙 |
Citrus cavaleriei |
二级 |
农业 |
|
金荞麦 |
Fagopyrum dibotrys |
二级 |
农业 |
|
川柿 |
Diospyros sutchuensis |
二级 |
农业 |
|
羽叶点地梅 |
Pomatosace filicula |
二级 |
农业 |
|
秃房茶 |
Camellia gymnogyna |
二级 |
农业 |
|
茶 |
Camellia sinensis var. sinensis |
二级 |
农业 |
|
疏齿大厂茶 |
Camellia tachangensis var. remotiserrata |
二级 |
农业 |
|
软枣猕猴桃 |
Actinidia arguta |
二级 |
农业 |
|
中华猕猴桃 |
Actinidia chinensis |
二级 |
农业 |
|
竹节参 |
Panax japonicus |
二级 |
农业 |
|
川明参 |
Chuanminshen violaceum |
二级 |
农业 |
|
松口蘑（松茸） |
Tricholoma matsutake |
二级 |
农业 |
|
中华夏块菌 |
Tuber sinoaestivum |
二级 |
农业 |
与1999年9月9日国家林业局、农业部第4号令发布的《国家重点保护野生植物名录（第一批）》相比，删除了中国蕨Sinopteris grevilleoides、玉龙蕨Sorolepidium glaciale、粗齿黑桫椤Alsophila denticulata、小黑桫椤Alsophila metteniana、半枫荷Semiliquidambar cathayensis、丁茜Trailliaedoxa gracilis、四川红杉Larix mastersiana、喜树（旱莲木）Camptotheca acuminata、油麦吊云杉Picea brachytyla var. complanata、樟树（香樟）Cinnamomum camphora、山莨菪Anisodus tanguticus、四川狼尾草Pennisetum sichuanense、异颖草Anisachne gracilis等物种。光叶珙桐Davidia involucrata var. vilmoriniana、毛红椿Toona ciliata var. pubescens两个变种分别并入珙桐Davidia involucrata、红椿Toona ciliata了。需要提醒注意的是，松口蘑（松茸）Tricholoma matsutake调整为农业农村部门主管了。